Facture électronique : guide TPE, indépendants et experts-comptables

Vous êtes concerné même en franchise en base de TVA : la réforme s'applique à toutes les entreprises assujetties, y compris celles qui ne facturent pas la taxe. Deux échéances à retenir : pouvoir recevoir des factures électroniques dès le 1er septembre 2026 (utile si vous avez des fournisseurs professionnels), et émettre vos propres factures au format électronique à partir du 1er septembre 2027.

En pratique pour un auto-entrepreneur qui facture peu ou pas d'autres entreprises, l'impact immédiat est faible : de nombreuses Plateformes Agréées proposent une offre gratuite pour la simple réception. L'essentiel est de ne pas laisser traîner l'inscription, pour ne pas passer à côté d'une facture fournisseur importante à partir de 2026.

Même calendrier que la micro-entreprise (réception 2026, émission 2027), mais l'enjeu opérationnel est plus grand : plus de volume de factures, plus de fournisseurs et de clients professionnels, souvent une comptabilité déjà outillée. Deux points d'attention spécifiques :

• Vérifier la compatibilité de votre logiciel de facturation avec un des trois formats du socle (Factur-X, UBL, CII) avant l'échéance d'émission de 2027, pour éviter une ressaisie manuelle.
• Choisir le bon niveau de maille dans l'annuaire si vous avez plusieurs établissements (SIRET) : recevoir toutes vos factures au même endroit ou les répartir par site.

La DGFiP a officialisé en 2025, par un courrier adressé au CNOEC, la possibilité de mandater son expert-comptable pour l'inscription à l'annuaire et la gestion de la Plateforme Agréée. C'est une réponse directe au manque de ressource interne des TPE et indépendants pour piloter cette obligation.

Le mandat est optionnel : l'entreprise reste responsable de ses obligations même si elle délègue la gestion opérationnelle. Pour le cabinet lui-même, deux sujets distincts à traiter séparément : ses propres obligations en tant qu'entreprise assujettie à la TVA (réception et émission de ses propres factures), et l'accompagnement de ses clients sur le choix et le paramétrage de leur PA.

De nombreux cabinets négocient une offre groupée auprès d'une PA partenaire pour mutualiser l'accompagnement de leurs clients TPE et PME, plutôt que de laisser chacun choisir isolément.

Pour la seule réception, comptez de 0 à quelques dizaines d'euros par mois selon les services. Beaucoup de banques de compte pro, de plateformes et de logiciels de facturation proposent la réception gratuite ou incluse dans un abonnement existant. Pour un indépendant qui reçoit peu de factures, une offre gratuite ou freemium suffit généralement : inutile de payer pour des fonctions dont vous n'avez pas besoin. Le budget augmente naturellement à partir de 2027, quand l'émission structurée et l'e-reporting entrent en jeu, surtout si vous avez besoin d'une intégration poussée avec votre outil comptable.

Dans l'ordre où nous conseillons de regarder, pour un profil TPE ou indépendant : votre banque de compte pro si elle est Plateforme Agréée, sinon votre logiciel de comptabilité ou de facturation, sinon votre expert-comptable s'il propose un accompagnement, et en dernier recours notre assistant de sélection.

En tant qu'auto-entrepreneur, dois-je vraiment m'en occuper si je facture peu ?

Oui, sans exception liée au volume de facturation. La seule obligation immédiate, avant le 1er septembre 2026, est de pouvoir recevoir des factures électroniques : ouvrir un compte chez une Plateforme Agréée, souvent gratuit pour un usage simple.

Mon expert-comptable peut-il s'occuper de la facture électronique à ma place ?

Oui, la DGFiP a officialisé en 2025 la possibilité de mandater son expert-comptable pour l'inscription à l'annuaire et la gestion de la Plateforme Agréée. Le mandat est optionnel et l'entreprise reste responsable de ses obligations : demandez à votre cabinet s'il propose cet accompagnement.

En tant qu'expert-comptable, dois-je choisir une PA pour mon cabinet et une autre pour mes clients ?

Ce sont deux sujets distincts. Votre cabinet, en tant qu'entreprise assujettie à la TVA, a ses propres obligations de réception et d'émission. Pour vos clients, vous pouvez soit les orienter vers une PA générique adaptée à leur profil, soit négocier une offre cabinet auprès d'une PA partenaire pour mutualiser l'accompagnement.

Quelle PA choisir pour une TPE avec un budget serré ?

Commencez par vérifier si votre banque professionnelle ou votre logiciel de facturation est déjà Plateforme Agréée : c'est le choix le plus économique, souvent inclus dans un abonnement existant. Sinon, plusieurs PA proposent une offre gratuite ou freemium pour la réception simple, largement suffisante pour un petit volume de factures.

Existe-t-il un accompagnement spécifique pour les indépendants qui ne s'y retrouvent pas ?

Notre assistant « Trouver ma plateforme » a été conçu pour ce profil : 3 questions (profil, budget, logiciel actuel) suffisent pour obtenir une sélection de Plateformes Agréées adaptées, sans jargon technique.

Pour aller plus loin : le mail DGFiP, que faire concrètement, le guide complet de la réforme et la sélection des meilleures plateformes pour indépendants.